XmnI
產(chǎn)品編號(hào) | 產(chǎn)品名稱 | 包裝規(guī)格 | 價(jià)格 |
NBS8230 | XmnI | 500 U | 300 |
產(chǎn)品簡(jiǎn)介:
XmnI屬于Type IIP型限制酶,來源于木薯萎蔫病黃單胞菌(Xanthomonas manihotis),經(jīng)大腸桿菌重組表達(dá)后純化獲得。XmnI識(shí)別并切割GAANN/NNTTC序列,切割后形成平末端,在Cut Buffer C中表現(xiàn)最佳的性能與星號(hào)活性控制。XmnI可兼容通用 FastCut Buffer,方便與其他內(nèi)切酶聯(lián)用實(shí)現(xiàn)快速雙酶切,但應(yīng)避免長時(shí)間酶切,以防止出現(xiàn)星號(hào)活性。
識(shí)別位點(diǎn):
GAANNNNTTC
5'...G A A N N↓N N T T C...3'
3'...C T T N N↑N N A A G ...5'
同裂酶:PdmI, MroXI
注:同裂酶對(duì)于不同的甲基化修飾可能具有不同敏感性。
產(chǎn)品組成:
組分 | 規(guī)格 |
XmnI (10 U/μl) | 50 μl |
10× Cut Buffer C | 1 ml |
保存條件:
-20℃保存,2年有效。
建議反應(yīng)條件:
1× Cut Buffer C;
37℃溫育;
參照“DNA 酶切流程”配制反應(yīng)體系。
失活條件:
80℃溫育20 min。
甲基化敏感性:
對(duì)于被 CpG 甲基化的 DNA,剪切可能受阻。
對(duì)于被EcoBI甲基化的DNA,剪切可能受阻。
活性定義:
1活性單位 (U) 是指在激活劑存在下,50 μl反應(yīng)體系中,37℃ 1 h 內(nèi)完全酶切1 μg λDNA 所需的酶量。
功能活性檢測(cè):
37℃下,10 U XmnI能夠在15 min內(nèi)完全消化1 μg λDNA。
超長時(shí)間溫育檢測(cè):
37℃下,將10 U XmnI與1 μg λDNA共同溫育3 h,未檢測(cè)到其他核酸酶污染或星號(hào)活性引起的底物非特異性降解。延時(shí)酶切可能出現(xiàn)星號(hào)活性。
酶切-連接-再酶切檢測(cè):
37℃下,使用10 U XmnI消化底物,回收酶切產(chǎn)物。在22℃下使用適量T4 DNA Ligase (Fast)可以將酶切產(chǎn)物重新連接。將連接產(chǎn)物再次回收后,使用相同的內(nèi)切酶可以重新切開連接產(chǎn)物。
使用方法:
1. DNA酶切流程
① 在冰上按如下建議的加樣順序配制反應(yīng)體系:
ddH2O | up to 50μl |
10× Cut Buffer C | 5μl |
底物DNAa | 1μg |
XmnI (10 U/μl) | 1μl |
Total | 50μl |
a. DNA 底物中應(yīng)不含苯酚、氯仿、乙醇、EDTA、洗滌劑或高濃度鹽,否則將會(huì)影響XmnI酶活性;
② 輕柔吸打或輕彈管壁以混勻(切勿渦旋),然后瞬時(shí)離心以收集掛壁液滴;
③ 37℃溫育1~3 h;
④ 80℃溫育20 min即可使酶失活,停止反應(yīng),或者通過吸附柱或苯酚/氯仿純化終止反應(yīng)。
不同DNA中的酶切位點(diǎn)數(shù)量
λDNA | ΦX174 | pBR322 | pUC57 | pUC18/19 | SV40 | M13mp18/19 | Adeno2 |
24 | 3 | 2 | 1 | 1 | 0 | 2 | 5 |
甲基化修飾影響
Dam | Dcm | CpG | EcoKI | EcoBI |
無影響 | 無影響 | 剪切受影響 | 無影響 | 剪切受阻 |
在不同反應(yīng)緩沖液中的活性
FastCut Buffer | Thermo Scientific FastDigest Buffer | NEB rCutSmart? Buffer | Takara QuickCut? Buffer | |
活性 | 100% | 100% | 100% | 100% |
注:活性數(shù)據(jù)來自限制酶標(biāo)準(zhǔn)反應(yīng)體系下的檢測(cè)。
注意事項(xiàng):
1. XmnI使用FastCut Buffer進(jìn)行酶切時(shí),酶切反應(yīng)時(shí)間建議不超過1 h。
2. 反應(yīng)體系中加入的酶體積不應(yīng)超過總體積的10%,避免酶中過多的甘油引起星號(hào)活性;
3. 限制性內(nèi)切酶存儲(chǔ)緩沖液中的添加劑(例如甘油、鹽)與底物溶液中的污染物(例如鹽、EDTA或乙醇等)相同,反應(yīng)體積越小,酶切反應(yīng)抑制效應(yīng)越強(qiáng);
4. 為了您的安全和健康,請(qǐng)穿實(shí)驗(yàn)服并戴一次性手套操作。
本產(chǎn)品僅用于生命科學(xué)研究,不得用于醫(yī)學(xué)診斷及其他用途!
相關(guān)常規(guī)限制性內(nèi)切酶產(chǎn)品:
產(chǎn)品編號(hào) | 產(chǎn)品名稱 | 包裝規(guī)格 |
100 U | ||
500 U | ||
50 U | ||
250 U | ||
300 U | ||
200 U | ||
500 U | ||
250 U | ||
500 U | ||
200 U | ||
250 U | ||
500 U | ||
250 U | ||
1000 U | ||
500 U |